Proposta di tesi presso il CINECA (triennale o magistrale)

L’enorme quantità di dati biologici prodotti con il sequenziamento massivo ha portato allo sviluppo di repository contenenti grandi dataset primari quali ad esempio “ The Cancer Genome Atlas” (TGCA) e “The Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE)”. Dataset di questo tipo sono oggetto di elaborazioni bioinformatiche per il “discovery” ed il “detecting” di diverse entità biologiche (es. varianti genetiche, eventi di “splicing” nei geni, eventi di “gene fusion”, ecc.).

Il lavoro di tesi che si propone è incentrato sullo sviluppo di librerie per interfacce web orientate alle entità biologiche per la navigazione e visualizzazione dei dati bioinformatici ottenuti in silico. Tali interfacce oltre a fonire un accesso web ottimizzato ai dati dovranno permettere ulteriori confronti a partire da sequenze o file di sequenze forniti dagli utenti.

La tesi si svolgerà sotto la supervisione del Professor Bottoni e della D.ssa Tiziana Castrignanò del CINECA.

Gli studenti interessati possono rivolgersi al Professor Bottoni.

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